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Il y a un peu plus de cinq ans, nous démarrions avec Cydwen le forum Végéweb, avec pour ambition de proposer un lieu de discussion virtuelle autour du végétarisme, et ouvert à tous. C’était à la fois un projet public, mais aussi la concrétisation d’un choix de vie personnel.

Depuis les premiers jours du forum, de l’encre numérique a coulé sous les ponts. Le forum a grandit, est devenu un lieu d’échange convivial, très riche en informations. Il s’est petit à petit mis à vivre tout seul, sans que l’on ai réellement besoin d’en guider les pas. À Cydwen comme à moi, cela nous a permis de rencontrer plein de gens, de voyager, d’accueillir des visiteurs d’autres contrées, de tisser des amitiés, etc. Je pense que de nombreuses autres personnes ont profité du forum pour cela aussi.

Et puis le temps passant, Cydwen a moins eu le temps de s’y consacrer. À mon tour, je me suis fait avalé par le quotidien, très gourmand en temps, et j’ai manqué d’énergie pour entretenir et animer le forum. Il continuait certes à vivre de lui-même, mais on sentait un certain endormissement. Et il y a peu, une nouvelle équipe a décidé de s’y coller : nouveau moteur de site, nouveau design, nouvelles énergies d’animation et de modération, mais en essayant de préserver l’idée originale de partage et de tolérance.

Ce forum est devenu en cinq années un lieu virtuel incontournable pour qui souhaite échanger sur la question, et j’en suis vraiment ravi. J’espère que ce nouveau souffle contribuera au dynamisme de la communauté qui gravite autour. Longue vie, végéweb !

Comme je l’annonçais précédemment, j’ai été recruté comme maître de conférences à l’Université d’Auvergne. Et parmi la foultitude de tâches plus ou moins amusantes que j’ai eu à accomplir depuis mon arrivée, j’ai passé un petit morceau de temps sur la mise en place d’outils de communication pour la jeune unité de recherche que je viens de rejoindre : charte graphique, intranet, listes de diffusion, site internet, etc. Ce n’est pas fini, mais ça a bien avancé.

Et puisque le site internet est maintenant en cours de stabilisation, et officiellement existant, il me fallait l’annoncer ici. Voici donc le nouveau site de l’ISIT, qui évoluera fort probablement au fil des prochains mois, mais qui est satisfaisant, en première approche. Il est basé sur drupal, que j’ai eu l’occasion de pousser comme jamais je ne l’avais fait auparavant. Bigrement flexible, cet outil !

Benoît Mandelbrot est décédé de 10 octobre 2010. Il est le découvreur de tout un pan des mathématiques, dont l’exploration a été rendue possible grâce à l’arrivée des ordinateurs. Il s’agit des fractales, bien sûr.

Quelques jours auparavant, Arte programmait un documentaire intitulé « Fractales, à la recherche de la dimension cachée ». J’avais loupé sa diffusion sur la chaîne. Mais heureusement, on le retrouve en visionnage sur internet : Fractales, à la recherche de la dimension cachée, sur le site d’Arte. Ce documentaire est assez divertissant, il raconte comment une nouvelle branche des sciences peut apparaître, explorée d’abord par un seul homme, puis comment elle peut attirer l’intérêt de nombreux autres scientifiques de plein de domaines différents. Les images sont superbes, ne le ratez pas !

J’ai peu le temps de poster ici ces derniers temps, principalement parce que cette période est riche en déplacements. J’espère avoir le temps et l’énergie d’écrire quelques billets sur les conférences récentes auxquelles j’ai participé. En attendant, je ne résiste plus à l’envie d’écrire ici la bonne nouvelle qui m’a été confirmée il y a peu par le site du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche : je suis recruté à la rentrée 2010 à l’Université d’Auvergne, comme maître de conférences.

Ceci marque donc la véritable fin de 10 années d’études, consacrées aux mathématiques et à l’informatique. J’ai de plus la joie d’avoir décroché un poste dans la ville où je souhaitais m’installer, pour être proche de ma fille.

Une petite description de ce que seront mes activités professionnelles pendant les années à venir : j’ai été recruté sur un poste dont l’enseignement se fera à l’IUT GEA (gestion des entreprises et des administrations), où j’aiderai les étudiants de cette formation professionnalisante à appréhender et maîtriser les outils informatiques, à la fois d’un point de vue pratique et théorique. La partie recherche, quant à elle, se fera dans un tout jeune laboratoire de l’Université, résultant de la fusion de l’ERIM (où j’avais réalisé mon pré-doc) et du LAIC. Si vous passez par Clermont-Ferrand, à partir de septembre prochain, je pourrai vous y accueillir avec plaisir !

Cela fait maintenant pas mal d’années que je fais mes propres fonds d’écrans, histoire d’agrémenter d’une touche personnelle l’apparence de mon bureau. J’avais déjà eu l’occasion de parler ici de fonds d’écrans dédiés à la distribution debian.

Je continue naturellement d’en réaliser, mais à un rythme moins soutenu maintenant, en particulier depuis que j’ai commencé à utiliser KDE 4. En effet, ce bureau propose de poser sur le fond d’écran un grand nombre de petits outils, appelés plasmoïdes. On y retrouve horloges, porte-photos, post-its, lecteurs de flux rss, météo, etc. Ainsi, en ce moment, l’un de mes bureaux ressemble à ça :

Au début, je voyais ces plasmoïdes comme des gadgets, mais à l’usage, ils sont vraiment pratiques. La conséquence de cette utilisation, c’est que les fonds d’écran ne doivent plus être aussi chargés qu’avant. Ainsi, on cherche plus à mettre une texture derrière les plasmoïdes, sans information supplémentaire. Il s’agit d’une certaine manière de fuir l’aspect froid et vide d’un fond uni.

J’ai donc commencé à réaliser des fonds d’écran pour ajouter un peu de texture. En utilisant ma tablette graphique, et en combinant plusieurs logiciels libres de qualité, comme alchemy, mypaint, ou encore les incontournables gimp et inkscape, on arrive rapidement et sans trop d’effort à des choses comme ça :

Pour l’instant, la gallerie n’en propose que trois, mais peut-être d’autres arriveront par la suite.

Pour qui a été qualifié au poste de maître de conférences ces deux dernières années, la traque aux postes disponibles est une activité très à la mode ces derniers temps. Suivant la section qui nous intéresse (c’est-à-dire la matière), on trouve plus ou moins facilement les informations utiles. Dans tous les cas, le canal officiel d’information pour les nouveaux postes est évidemment le site du ministère de l’enseignement supérieur et de la recherche, qui propose une liste à jour des postes publiés, sous forme de fichiers pdf contenant des liens vers les fiches descriptives des postes.

Le site propose bien de s’inscrire pour être informé des mises à jour, mais rien de vraiment très pratique. J’ai donc écrit rapidement un script en python qui télécharge la liste des postes, fait la liste des postes dans une section donnée, télécharge les fiches descriptives correspondantes, et indique la date de fin de candidature. À noter que seuls les nouveaux postes sont téléchargés de nouveau, si l’on relance une nouvelle fois le script après une première utilisation.

Ce script est naturellement disponible sous licence libre, sans garantie qu’il fonctionne correctement pour toutes les situations, et dans les temps à venir. En effet, son bon fonctionnement dépend de nombreux paramètres, dont notamment la forme des fichiers proposés sur le site du ministère.

Pour le téléchargement, c’est par là : liste-postes.py. N’oubliez pas de le renommer en « .py », au cas où il présenterait une extension exotique du type « py.txt »…

Il y a quelques temps, j’étais tombé sur un journal de linuxfr qui parlait de logiciels de dessin sous GNU/Linux. J’avais vraiment envie d’essayer ces logiciels, et je regrettais terriblement d’avoir mis ma bonne vieille petite graphire 2 dans les cartons pour une année. Cette tablette graphique avait beau être au format A6, j’aimais gribouiller avec.

Et puis à l’occasion de ma soutenance de thèse, j’ai eu l’énorme surprise de recevoir de mes amis, collègues et famille une tablette graphique de chez wacom vraiment géniale. Comparée à la graphire, elle me semble gigantesque. Elle est beaucoup plus précise, et l’ergonomie n’a rien à voir. Vraiment incroyable !

Lorsque j’ai déménagé à Genova, je n’avais pas assez de place dans mes bagages pour la transporter, aussi elle a attendu mon passage suivant à Clermont-Ferrand pour atterrir en Italie.

Je n’ai donc pas attendu, et depuis maintenant quelques jours, je joue avec MyPaint, un logiciel libre aux fonctionnalités simples mais bien pensé, qui permet d’exploiter les possibilités de la tablette graphique. On y retrouve, en accès rapide, des outils de dessin type crayon à papier, feutres, peinture, etc. L’interface est assez ergonomique, on peut facilement jongler avec plusieurs couleurs, changer la taille de l’outil. Une autre excellente idée : la « feuille » sur laquelle on dessine n’est pas limitée en taille, ce qui permet de dessiner sans se préoccuper des bords de l’image. Extrêmement malin.

Je crois que je n’ai pas fini de m’amuser avec ce logiciel et mon joli cadeau. Merci !

Lorsque j’étais à Londres cet été, j’ai notamment passé une bonne partie de mes nuits et week-ends à finir la rédaction de ma thèse. Mais quand ce travail de fourmi devenait trop pesant, j’ai commencé à travailler à une vulgarisation de mes sujets de recherche, en commençant une série de planches de bande-dessinée illustrant différents concepts et algorithmes topologiques et géométriques.

Pour continuer à diffuser ces documents, déjà présents en annexe D du manuscrit, je viens de créer une page dédiée sur mon site professionnel. En bas de cette page, vous trouverez également des liens vers d’autres illustrations sur des sujets proches. Si vous connaissez d’autres illustrations du même type, n’hésitez pas à m’en faire part !

Voici donc le lien vers les illustrations de concepts topologiques et géométriques.

Je suis en ce moment en train de finaliser mes travaux de thèse, et plus précisément de mettre toute mon énergie dans la rédaction du manuscrit qui concluera trois années de recherche au LIMOS. Contrairement à beaucoup de doctorants, j’y prends pas mal de plaisir, car c’est l’occasion de raconter dans le détail ce qui m’a amusé scientifiquement pendant ces trois années.

Pour rédiger ce document, j’ai naturellement choisi d’utiliser le logiciel LaTeX, qui offre une énorme flexibilité, assure une bonne rigueur de présentation et permet de se concentrer pleinement sur le contenu. Et puisque c’est un document important à mes yeux, je fais des sauvegardes régulières sur plusieurs ordinateurs, utilisant notamment un système de gestion de versions afin de ne rien perdre de mes avancées. Cependant, il m’arrive de passer une journée entière sans faire aucune sauvegarde, pris dans l’élan de la rédaction, et profitant de la liberté géographique qu’offre l »utilisation d’un ordinateur portable.

C’est ainsi qu’au soir du 2 juin dernier, à la suite d’une maladresse informatique ridicule (un caractère « * » s’étant glissé dans une commande « rm »), j’ai perdu tout le travail de ma journée. Et on va être honnête, c’est très rageant. Après quelques instants de réflexion, j’ai décidé de tenter de récupérer ces données, qui devaient encore être inscrites sur le disque dur même si non visibles par le système.

J’ai donc immédiatement démonté la partition, pour éviter d’écraser les informations qui m’intéressaient, puis j’ai cherché un peu, et suis tombé sur un document qui correspondait exactement à mes besoins : HOWTO rescue deleted Linux files. L’idée est d’utiliser un script qui parcourt le disque dur comme un énorme fichier, et recherche à l’intérieur les extraits typiques des documents recherchés. Comme tous mes fichiers de travail commençaient par « \chapter », je n’ai eu qu’à modifier légèrement le script, puis à le lancer et attendre. Après quelques dizaines de minutes, une cinquantaine de fichiers avaient été retrouvés, et après vérification, correction et réajustement, j’ai pu tout retrouver ! Merci YakPeople !

Depuis décembre 2005, c’est-à-dire quasiment depuis le début de mon pré-doc à l’ERIM, j’utilise au quotidien un wiki pour consigner et structurer mes différentes activités professionnelles.

Les débuts étaient un peu chaotiques, mais j’ai pris une bonne vitesse de croisière. Ainsi, je décris chaque jour en quelques lignes mon activité, qui constitue la trame de ma progression au quotidien, un peu à la manière d’un blog. Puis j’ai petit à petit créé une nébuleuse de pages, reliées les unes entre les autres pour faciliter la navigation, et structurées par grandes catégories (recherches bibliographiques, rédaction d’articles, réflexions sur les concepts en cours d’élaboration, etc.).

Cette manière de fonctionner a de multiples intérêts :

• Disposer d’un aide-mémoire complet, structuré, non linéaire (car interconnecté), et interrogeable à l’aide d’une fonction de recherche depuis n’importe où sur internet (voir en local après avoir fait une copie) ;
• Poser et structurer en un même endroit les tâches à faire, les réunions à venir, leurs comptes-rendus ;
• Permettre le travail collaboratif, notamment lors de la rédaction d’un article ;
• Faciliter grandement l’interaction entre le doctorant et le directeur de thèse. En effet, ce dernier peut suivre quotidiennement les avancées, et les réunions deviennent très efficaces, car on évite de faire le tour des choses déjà écrites.
• Rendre accessible (en utilisant un système de contrôle d’accès) une partie des données suivant le type de visiteur.

J’ai déjà eu l’occasion de présenter à plusieurs doctorants cet outil, et déjà deux d’entre eux ont adopté un système similaire pour structurer leurs travaux.

Lorsque j’ai démarré, j’avais choisi d’utiliser wikini, car c’était le moteur de wiki que je connaissais le mieux. Cependant après quelques années d’utilisation, alors que j’avais envie de lui ajouter de nouvelles fonctionnalités, j’ai constaté ce que je savais déjà : cet outil n’était plus développé activement. J’ai donc décidé de migré mon wiki de travail sur dokuwiki.

Après une recherche rapide sur internet, j’ai découvert avec amusement que Gulliver, le GULL rennais était en train de faire le même type de migration, et avait entrepris de réaliser un outil de migration. J’ai alors profité du fait qu’ils l’avaient placé sous licence libre pour l’adapter à mes besoins, puis j’ai envoyé au mainteneur mes contributions, qu’il a intégré (voir le dépôt de l’outil de migration ; encore merci aux gens de Gulliver qui ont travaillé sur ce script).

J’ai ensuite réalisé un thème adapté à mes envies, puis créé un petit module de grisement de texte.

Voici donc un lien vers mon wiki de thèse, qui deviendra certainement le wiki de mes travaux universitaires.